El laboratorio de biología propio de Anthropic ha publicado la primera estructura 3D de una partícula vault de una célula procariota, y para la mayoría de lectores la noticia más útil es cómo se hizo el trabajo. Las vaults son grandes barriles huecos de proteína presentes en casi todo el árbol de la vida, desde los mohos mucilaginosos hasta los humanos, y nadie ha confirmado para qué sirven. El equipo dice que Claude estuvo presente en cada paso, desde buscar en bases de datos de secuencias hasta procesar los datos del microscopio, y que eso redujo semanas de trabajo a días.
La partícula procede de una proteína fabricada por un bacteriófago, un virus que infecta bacterias. Con criomicroscopía electrónica, el equipo vio que la cubierta se ensambla a partir de 96 copias de una sola proteína, 48 en cada mitad, mientras que la vault humana usa 78. Pesa unos 9.5 megadaltons, lo que según Anthropic la sitúa entre las cubiertas de proteína más grandes identificadas en procariotas. Su pared está formada por siete segmentos repetidos en lugar de los nueve de las vaults de mamíferos, y sus tapas se cierran en tres niveles, con copias vecinas de la misma proteína adoptando formas distintas en la parte superior.
Después, el equipo modificó la proteína de 15 maneras, sobre todo donde se tocan las copias vecinas. Algunos cambios únicos cerca de la tapa impidieron que la cubierta se cerrara y dejaron partículas abiertas en forma de roseta. Añadir dos segmentos más a la pared, hasta igualar los nueve de la versión humana, produjo vaults más grandes con alrededor de un 20% más de volumen interior. Eso sugiere una forma en que las vaults pudieron cambiar de tamaño a lo largo de la evolución, y explica por qué podría interesar a quienes investigan nanocápsulas de proteína para transportar enzimas.
La afirmación sobre la velocidad es concreta. Anthropic dice que purificar vaults suele llevar tres días y aquí llevó unos 90 minutos, y que el primer modelo estructural estuvo listo 34 horas después, frente a unas semanas estimadas a mano. Claude, bajo la dirección de los científicos, buscó en bases de datos de proteínas, diseñó construcciones de ADN, ajustó el método de aislamiento y procesó los datos de microscopía. Esto sigue al informe anterior del mismo laboratorio sobre un sistema enzimático hallado con Claude, y es el ejemplo público más claro hasta ahora de Claude usado como herramienta de trabajo en biología de laboratorio y no como chatbot.
Los límites importan. Los resultados están en un preprint enviado a bioRxiv y no han pasado revisión por pares, las estructuras y los datos adicionales están prometidos pero aún no publicados, y las cifras de velocidad son estimaciones de la propia Anthropic. La pregunta central, qué hacen realmente las vaults, sigue abierta; el Dr. Rome, investigador de vaults que asesoró al equipo, dice que averiguar su función es enormemente difícil. Quien valore Claude para trabajo de investigación debería tomar esto como un buen caso práctico de su fabricante, no como una prueba independiente.